54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1317 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 66 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  51.85 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.33 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  42.37 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  47.46 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.83 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.76 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.47 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.9 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.1 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.89 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.47 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.03 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.03 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.03 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.31 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.55 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.33 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3739  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  61.11 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0667071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  61.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1851  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  70.37 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.353337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.19 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.19 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.19 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.1 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.1 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2577  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.84 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0712081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  61.29 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  66.67 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.49 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.92 
 
 		 72 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.21 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  48.39 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.12 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  62.96 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14810  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0436889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  62.96 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.34 
 
 		 72 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.34 
 
 		 72 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>