112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1760 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  56.52 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  57.97 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.54 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.54 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  52.31 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.03 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.68 
 
 
63 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2002  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.76 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.32 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.93 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.37 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.86 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0914  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.86 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  45 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.54 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.73 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.6 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4972  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.73 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001863  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  39.66 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.91 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  55.32 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.91 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.99 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.99 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.19 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02820  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  70 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.84 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.29 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1213  RNA polymerase, omega subunit  38.89 
 
 
86 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.24 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5301  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337181  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1991  RNA polymerase omega subunit  33.93 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1986  RNA polymerase omega subunit  33.93 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1716  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.71 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.32 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2281  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715758  normal  0.333342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.71 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5349  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0172  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840834  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.31 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0961  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.29 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0127007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4389  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.48 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.44 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2879  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.92 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000467592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00154  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.93 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0430538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0211  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1694  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.23 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 
117 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3624  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 
91 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.62 
 
 
93 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03506  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0056  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.18 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0090  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3860  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4152  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0062  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3984  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4100  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4021  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4067  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.912387  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3958  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4128  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5021  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03458  hypothetical protein  36.21 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0034  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.48 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0111  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0348  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.93 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70450  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.85 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6113  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.85 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0044  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.93 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.46 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.71 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>