58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4008 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 
70 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  95.71 
 
 
70 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  92.86 
 
 
70 aa  133  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 
70 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  85.71 
 
 
70 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  58.46 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  62.96 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  46.38 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  51.85 
 
 
72 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50.98 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.27 
 
 
70 aa  52  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.67 
 
 
78 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  56.36 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.15 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 
63 aa  47.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.79 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.33 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.19 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.43 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.31 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.31 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  67.86 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.58 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.67 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2437  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.03 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.16 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.18 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1716  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 
97 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 
91 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.33 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  48.39 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.16 
 
 
93 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  60 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.49 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.84 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.49 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3739  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.49 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0667071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 
151 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.8 
 
 
94 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>