54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1712 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  54.29 
 
 		 72 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50.72 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  62.69 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  59.38 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  54.69 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  54.24 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  39.81 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.12 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  55.56 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.37 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.48 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.62 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.44 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.08 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.55 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.55 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.21 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.94 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.49 
 
 		 86 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.34 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.34 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.14 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3158  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  39.74 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281429  hitchhiker  0.0000123273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02820  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.92 
 
 		 87 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0172  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840834  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5349  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.44 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.84 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5301  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337181  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715758  normal  0.333342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.62 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.18 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  55.17 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70450  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.18 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6113  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.18 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.88 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14810  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0436889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>