45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3158 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3158  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  100 
 
 		 106 aa  210  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281429  hitchhiker  0.0000123273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1851  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  75 
 
 		 88 aa  134  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.353337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  78.41 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75.86 
 
 		 90 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75.9 
 
 		 88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  72.22 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  78.05 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  74.7 
 
 		 88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  73.81 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  77.5 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  74.7 
 
 		 87 aa  124  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2437  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  73.49 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1716  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  66.67 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14810  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0436889  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  59.43 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  72.29 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  71.08 
 
 		 88 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  80.28 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  68.67 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  76 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  72.15 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  75.34 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  69.62 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  69.88 
 
 		 93 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  69.62 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  69.62 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  68.67 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  65.88 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3739  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  72.6 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0667071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  72.6 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  70.51 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  71.23 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  76.06 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  69.86 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2577  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  69.86 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0712081  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0914  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  61.54 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60.26 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1694  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.87 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.83 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1472  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.62 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.57 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  27.17 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  39.74 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.57 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>