101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09820 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 
70 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  55.56 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  51.52 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  44.12 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.62 
 
 
70 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.88 
 
 
78 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  54.39 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.15 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50.88 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000980407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.1 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.46 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.1 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.62 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3212  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000144072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2326  RNA polymerase, omega subunit  50.88 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968364  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.77 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.12 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1051  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.28 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000307419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.83 
 
 
70 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.44 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.44 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 
70 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.03 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.06 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.67 
 
 
87 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2400  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0782645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.46 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.33 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.33 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1286  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.1 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000230469  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.94 
 
 
86 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.94 
 
 
86 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2285  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.15 
 
 
68 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.54 
 
 
151 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 
88 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.06 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4389  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.98 
 
 
87 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.06 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.06 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02820  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.28 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.97 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.54 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  33.33 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.86 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.35 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.35 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.89 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.98 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1851  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.33 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.353337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.9 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.27 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.44 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1758  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238349  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.67 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0844  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.94 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.59 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.36 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4972  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.89 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.59 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0635  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5301  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.29 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337181  normal  0.206293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3234  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.29 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.665488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.29 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715758  normal  0.333342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5349  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.29 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0172  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.29 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840834  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.67 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.07 
 
 
98 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.49 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70450  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.59 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6113  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.59 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.67 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.33 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1991  RNA polymerase omega subunit  35.59 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1986  RNA polymerase omega subunit  35.59 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.68 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.9 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.33 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.11 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3844  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.48 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1694  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.71 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001863  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  35.19 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>