42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0844 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0844  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.42 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.62 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.62 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.62 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.31 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.08 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.33 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.44 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2577  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.81 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0712081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.71 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.71 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.39 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.27 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.94 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.46 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.81 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1716  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.76 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.62 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.76 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.81 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.81 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.24 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0914  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.92 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.68 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.46 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.68 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.34 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.36 
 
 		 70 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.36 
 
 		 70 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.29 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.29 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3739  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.92 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0667071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.92 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.92 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.76 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.29 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>