67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0759 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  100 
 
 		 72 aa  144  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.77 
 
 		 72 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50.72 
 
 		 70 aa  77  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  51.52 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  54.1 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  56.67 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  56.67 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.88 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  34.95 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  52.83 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.98 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.03 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.12 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.67 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0252  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.07 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.46 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.37 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.37 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.28 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.28 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.77 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.06 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.76 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.68 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1758  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.83 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238349  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.64 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.46 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0280  RNA polymerase, omega subunit  35.09 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0796  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.09 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.61 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000125456  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.33 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.71 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.33 
 
 		 88 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.92 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000980407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70450  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.85 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.84 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6113  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.85 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.1 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0635  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.89 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4389  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.85 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.5 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.03 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  59.38 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  54.55 
 
 		 110 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  56.25 
 
 		 87 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>