64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1036 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 77 aa  153  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.21 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.21 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  52.31 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.62 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.62 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.12 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  38.03 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.73 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.08 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.46 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.1 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.6 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.6 
 
 		 91 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.71 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.45 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.94 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.94 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  30.3 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  41.94 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.81 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000980407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3212  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.84 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000144072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.32 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.25 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.43 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.43 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.25 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.34 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2326  RNA polymerase, omega subunit  34.38 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.51 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1051  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.84 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000307419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0857  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.88 
 
 		 67 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.82 
 
 		 87 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2472  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.88 
 
 		 67 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4018  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  26.23 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.07 
 
 		 63 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.88 
 
 		 111 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0074  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.82 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.51 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  32.47 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.71 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  30.65 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2275  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0173357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.51 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  32.2 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1955  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.33 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.51 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2400  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.34 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0782645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0844  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.92 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.33 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2094  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  35.62 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.490083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  30.14 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1320  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.29 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.100199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0172  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  28.79 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840834  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5349  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  28.79 
 
 		 87 aa  40  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  32.43 
 
 		 94 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5210  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  28.79 
 
 		 87 aa  40  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.715758  normal  0.333342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.34 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5301  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  28.79 
 
 		 87 aa  40  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337181  normal  0.206293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>