51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2317 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  57.35 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  51.47 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  54.41 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.06 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.59 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.33 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0844  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.33 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1472  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.07 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.03 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.45 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0961  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0127007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.1 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.71 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.29 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  48.21 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.37 
 
 		 117 aa  43.5  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  52.27 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.07 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.1 
 
 		 88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.1 
 
 		 88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.1 
 
 		 88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.71 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.03 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.24 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3186  RNA polymerase, omega subunit  46.15 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.29 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.55 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.82 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.81 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.24 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.35 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.53 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.76 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1320  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.36 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.100199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.66 
 
 		 104 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>