51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3210 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 86 aa  178  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.42 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.1 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1472  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50.7 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111118  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1851  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.353337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  52.86 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2043  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529768  decreased coverage  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  51.43 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.61 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.61 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  51.43 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.65 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2258  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.61 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1292  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.336448  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.75 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.22 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.22 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.37 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  52.24 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1694  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.07 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.1 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14810  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.58 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0436889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.89 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.3 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1716  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.21 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0914  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.8 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.58 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.42 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3158  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  47.83 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281429  hitchhiker  0.0000123273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.48 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.31 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2437  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.76 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3739  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.07 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0667071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.07 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.14 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2577  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.66 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0712081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.19 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.72 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.96 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3777  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.85 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.62 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.03 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.84 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>