50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3693 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 70 aa  140  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  82.86 
 
 		 70 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  81.43 
 
 		 70 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  81.43 
 
 		 70 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  79.41 
 
 		 70 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  64.81 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  64.81 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  49.09 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  51.85 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50.98 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.78 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1294  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1269  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.78398  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.06 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.28 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50.91 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.83 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.37 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.55 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.62 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.33 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.19 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3006  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.53 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2437  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.1 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  67.86 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.53 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2991  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.89 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.81 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.14 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.46 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  48.39 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.21 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.03 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1317  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  64.29 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287217  normal  0.237798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  58.06 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2371  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0664219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2418  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1855  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2412  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.62 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.620348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2668  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.21 
 
 		 104 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  60.71 
 
 		 87 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>