30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0452 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1409  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 74 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0452  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 74 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1289  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 74 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0171215  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0616  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  69.01 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1213  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  61.11 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0501  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  63.24 
 
 		 71 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0482  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  61.76 
 
 		 71 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0646  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  57.14 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1282  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  57.14 
 
 		 74 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.587264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  53.45 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0718  RNA polymerase Rpb6  44.44 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3844  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.02 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1213  RNA polymerase, omega subunit  49.09 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.15 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.94 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.83 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.83 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.45 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.3 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3528  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408605  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.68 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  53.06 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  53.06 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.17 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1727  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.121301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.68 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4018  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2326  RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3212  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.86 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000144072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0034  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.83 
 
 		 107 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>