57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4809 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  100 
 
 		 349 aa  725    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  34.42 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.84 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  30.54 
 
 		 364 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.04 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.95 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.63 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  32.63 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  29.34 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.96 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.87 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  31.8 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  30.23 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.95 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  28.53 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.09 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.22 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.22 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.41 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.83 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  26.65 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.07 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.92 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.22 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  25.9 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  24.22 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  24.22 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.9 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  24.29 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.15 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.63 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  23.71 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  23.91 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  23.39 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  21.52 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  24.06 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.38 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.3 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  20.14 
 
 		 494 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  23.93 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.68 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  22.3 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.51 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.51 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  23.62 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.69 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25 
 
 		 530 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  24.47 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  23.83 
 
 		 537 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  21.24 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.55 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.98 
 
 		 519 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.12 
 
 		 514 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.12 
 
 		 514 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  18.75 
 
 		 500 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.69 
 
 		 519 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>