48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0215 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 341 aa  678    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  46.56 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  45.09 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  42.06 
 
 		 328 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.79 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.07 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.07 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  41.31 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  43.71 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  35.49 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.61 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.87 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  27.95 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.74 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.1 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  24.49 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.49 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  26.86 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.35 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  27.85 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  27.9 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.37 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  26.12 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.21 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.88 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.47 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.86 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.53 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.5 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  22.91 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.7 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  24.33 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  21.9 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.47 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  24.72 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  24.92 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  25.09 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  24.92 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.54 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  22 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.15 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  20 
 
 		 527 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  22 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.9 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.77 
 
 		 519 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  21.62 
 
 		 511 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>