44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1594 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  100 
 
 		 341 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.71 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  37.66 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  39.37 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  37.85 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.03 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.99 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  35.46 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  35.46 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.83 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.39 
 
 		 378 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.72 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  25.86 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  26.44 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.9 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.8 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  24.57 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.85 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.2 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  22.61 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  22.61 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  26.15 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  24.72 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.7 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  22.46 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.47 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  23.38 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.34 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  21.75 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.97 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  23.29 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.07 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.53 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.67 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.01 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.83 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  21.83 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.78 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  25.15 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  27.22 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  27.27 
 
 		 555 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  27.27 
 
 		 555 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  27.27 
 
 		 560 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  21.99 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>