35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  100 
 
 
330 aa  675    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  63.91 
 
 
327 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  57.58 
 
 
329 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  59.82 
 
 
331 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  58.31 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  57.45 
 
 
331 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  56.67 
 
 
331 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  57.61 
 
 
335 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  56.67 
 
 
331 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  57.61 
 
 
335 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  57.49 
 
 
335 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  53.92 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  51.36 
 
 
331 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.24 
 
 
331 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.46 
 
 
340 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  51.82 
 
 
332 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  50.17 
 
 
331 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  41.55 
 
 
342 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  23.72 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.43 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  22.43 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  25.62 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  24.06 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  25.47 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.36 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.36 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.21 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.6 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.75 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.49 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.4 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.84 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 
378 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.59 
 
 
367 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.48 
 
 
357 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>