41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0818 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  100 
 
 		 328 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  75 
 
 		 328 aa  534  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  72.56 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  72.17 
 
 		 329 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  72.17 
 
 		 329 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.12 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.03 
 
 		 332 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.54 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.13 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  34.22 
 
 		 378 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  39.37 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.83 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  30 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  26.65 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  27.8 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  26.71 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  27.86 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.5 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  26.15 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.69 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.51 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.37 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.13 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  27.9 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.18 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.89 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  25.16 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  26.24 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  26.24 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  24.41 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.23 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.84 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.88 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.38 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.02 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  22.91 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.91 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  24.14 
 
 		 365 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.89 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.63 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  22.53 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>