39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1786 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 331 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  83.33 
 
 		 340 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  50.31 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  52.11 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  54.52 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.09 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.04 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.15 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  51.81 
 
 		 331 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.19 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  45.92 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.45 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  49.24 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.46 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  47.46 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  47.46 
 
 		 335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  48.34 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  39.01 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.36 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  23.36 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.81 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.53 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.61 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.83 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.35 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.35 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.76 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  22.29 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.47 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.41 
 
 		 328 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  23.79 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  28.89 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  25.71 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  21.69 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.37 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  21.86 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.67 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.31 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.21 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>