26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2200 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 
376 aa  779    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.34 
 
 
378 aa  371  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.13 
 
 
328 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  31.23 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  31.83 
 
 
328 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.03 
 
 
332 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.07 
 
 
329 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.07 
 
 
329 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.87 
 
 
341 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.82 
 
 
328 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.73 
 
 
341 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  29.72 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.65 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  21.99 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.09 
 
 
367 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.64 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  22.51 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  19.92 
 
 
537 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  18.75 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  21.27 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  19.57 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.31 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.24 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.84 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  21.34 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  20.51 
 
 
530 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>