49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1312 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 328 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  77.44 
 
 		 328 aa  544  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  75 
 
 		 328 aa  534  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  70.73 
 
 		 328 aa  500  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.64 
 
 		 329 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.64 
 
 		 329 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.58 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  41.82 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.05 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.33 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  37.85 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.13 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  27.4 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  26.07 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  27.8 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  27.06 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  26.48 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.46 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.21 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.57 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.72 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.83 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.72 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  27.04 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.93 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.59 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.18 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  24.21 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  21.9 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  21.9 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  22.78 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  21.32 
 
 		 555 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  21.4 
 
 		 556 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  26.83 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  22.18 
 
 		 556 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  21.71 
 
 		 555 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  21.71 
 
 		 560 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.01 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.28 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.98 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.29 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  20.69 
 
 		 555 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.63 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  25.29 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.55 
 
 		 364 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  21.4 
 
 		 526 aa  45.8  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  20.69 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.79 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  20.99 
 
 		 552 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>