43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1651 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  76.87 
 
 		 555 aa  910    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.7 
 
 		 545 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  100 
 
 		 552 aa  1154    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  76.73 
 
 		 555 aa  912    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  79.64 
 
 		 556 aa  936    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  78.87 
 
 		 555 aa  931    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  76.91 
 
 		 560 aa  914    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  79.42 
 
 		 556 aa  939    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  90.22 
 
 		 552 aa  1069    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  61.8 
 
 		 549 aa  704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  38.93 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  30.84 
 
 		 527 aa  217  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  30.93 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.96 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.58 
 
 		 500 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.52 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.29 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  27.78 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.29 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.16 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.57 
 
 		 504 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  28.42 
 
 		 505 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  24.66 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  29.35 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.71 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.74 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  27.29 
 
 		 527 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.63 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.22 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  26.23 
 
 		 537 aa  99.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  28.06 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.88 
 
 		 514 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.77 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.77 
 
 		 514 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.92 
 
 		 502 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.98 
 
 		 519 aa  97.4  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  29.08 
 
 		 517 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.48 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.92 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.27 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.18 
 
 		 263 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.66 
 
 		 328 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.99 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>