43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3794 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  63.53 
 
 		 537 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.95 
 
 		 502 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  68.09 
 
 		 514 aa  755    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  65.96 
 
 		 505 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  59.29 
 
 		 511 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  71.57 
 
 		 517 aa  811    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  68.09 
 
 		 514 aa  755    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.19 
 
 		 528 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.98 
 
 		 504 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  65.42 
 
 		 527 aa  716    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  66.99 
 
 		 519 aa  747    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.58 
 
 		 514 aa  749    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  66.34 
 
 		 515 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  100 
 
 		 517 aa  1090    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  66.73 
 
 		 530 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  68.16 
 
 		 514 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.31 
 
 		 516 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  66.67 
 
 		 519 aa  746    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  28.04 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  27.96 
 
 		 501 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  28.54 
 
 		 499 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.73 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.82 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.27 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.89 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.44 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.94 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.94 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  25.43 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  27.23 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  27.59 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  29.08 
 
 		 552 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  26.38 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  26.56 
 
 		 560 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  27.21 
 
 		 555 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  23.74 
 
 		 549 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  25.42 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  24.37 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.67 
 
 		 545 aa  90.1  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  24.67 
 
 		 526 aa  87  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.52 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  27.94 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  28.42 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>