40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0546 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  638    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  57.1 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  39.58 
 
 		 501 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.91 
 
 		 531 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  40.07 
 
 		 500 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  37.12 
 
 		 501 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  37.12 
 
 		 501 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  38.62 
 
 		 501 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  37.6 
 
 		 494 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  40.55 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.24 
 
 		 497 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  34.52 
 
 		 519 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  35.03 
 
 		 505 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.85 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.85 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.82 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  34.83 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.12 
 
 		 516 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.44 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  30.61 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.49 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.96 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.1 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.5 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.12 
 
 		 528 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  30.61 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  28.42 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  27.64 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  29.38 
 
 		 527 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  26.61 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  27.23 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  26.34 
 
 		 556 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2539  toluene monooxygenase alpha subunit  37.25 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  25.25 
 
 		 555 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  26.57 
 
 		 555 aa  46.6  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  26.34 
 
 		 552 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  27.18 
 
 		 560 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  27.18 
 
 		 555 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  32.95 
 
 		 545 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  25.97 
 
 		 527 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>