36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2196 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  100 
 
 		 310 aa  643    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  57.1 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  44.13 
 
 		 501 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.63 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.55 
 
 		 500 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  43.6 
 
 		 501 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  39.22 
 
 		 501 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  39.22 
 
 		 501 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  40.28 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  40.45 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  39.34 
 
 		 494 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  31.25 
 
 		 505 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.46 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.6 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.6 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  30.49 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.3 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.7 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.7 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  29.54 
 
 		 527 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  29.7 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.37 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.94 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  26.91 
 
 		 537 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.57 
 
 		 516 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.7 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.29 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.21 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  28.71 
 
 		 511 aa  66.2  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  27.3 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  24.34 
 
 		 556 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  23.89 
 
 		 556 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  22.17 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2539  toluene monooxygenase alpha subunit  38.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  22.39 
 
 		 527 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  25.73 
 
 		 555 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>