44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0211 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  64.4 
 
 		 494 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 531 aa  1093    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  57.11 
 
 		 500 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  55.87 
 
 		 501 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  53.85 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  55.06 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  55.06 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  56.43 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.62 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.59 
 
 		 263 aa  226  6e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  39.26 
 
 		 310 aa  197  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  40.45 
 
 		 310 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.54 
 
 		 502 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.95 
 
 		 504 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  27.55 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.74 
 
 		 530 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.82 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.88 
 
 		 519 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.73 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  25.59 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.16 
 
 		 517 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.34 
 
 		 516 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.56 
 
 		 528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  24.18 
 
 		 501 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  26.45 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  25.64 
 
 		 527 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.97 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.2 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.37 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.48 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  25.17 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.48 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  24.7 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  25.97 
 
 		 555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  24.22 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  25.55 
 
 		 560 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  25.55 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  24.57 
 
 		 552 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  24.63 
 
 		 552 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2539  toluene monooxygenase alpha subunit  62.86 
 
 		 130 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.83 
 
 		 545 aa  98.2  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  23.93 
 
 		 549 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  23.17 
 
 		 527 aa  94  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  21.51 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>