46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1262 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  82.89 
 
 		 527 aa  947    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  100 
 
 		 526 aa  1103    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  32.93 
 
 		 501 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  32.16 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  31.64 
 
 		 556 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  29.67 
 
 		 555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  29.21 
 
 		 555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  28.39 
 
 		 556 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  29.07 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  29.07 
 
 		 555 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  30.93 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  29.91 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.46 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  26.62 
 
 		 505 aa  97.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  24.31 
 
 		 494 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.31 
 
 		 502 aa  93.6  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.62 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.06 
 
 		 515 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.06 
 
 		 530 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.51 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.67 
 
 		 517 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  24.29 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.96 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.66 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.5 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.06 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.51 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.35 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.35 
 
 		 514 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.24 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.57 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  21.65 
 
 		 537 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.21 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  22.66 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.18 
 
 		 500 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.18 
 
 		 519 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.35 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.4 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.35 
 
 		 501 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  24.25 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.12 
 
 		 263 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.27 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.27 
 
 		 329 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.4 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.4 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.45 
 
 		 328 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>