42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5675 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 
332 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  88.75 
 
 
329 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  88.75 
 
 
329 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  70.03 
 
 
328 aa  484  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.58 
 
 
328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  66.67 
 
 
328 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  65.75 
 
 
328 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.41 
 
 
341 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.06 
 
 
341 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.94 
 
 
378 aa  202  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  36.99 
 
 
341 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.03 
 
 
376 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  28.76 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  25.83 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.83 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  26.09 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.09 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  26 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.02 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.81 
 
 
331 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.4 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.71 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.49 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  25.5 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.1 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  26.94 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.39 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  23.46 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  23.46 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  24.39 
 
 
352 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  24.92 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.03 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.74 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  23.9 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  24.31 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.59 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.31 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  20.53 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  19.42 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  23.42 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  21.4 
 
 
526 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  24.08 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>