29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1263 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  100 
 
 		 391 aa  803    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  62.15 
 
 		 389 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  31.8 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  26.82 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  28.77 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.74 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.77 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  27.15 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.15 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.44 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.68 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.86 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.81 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.1 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  23.44 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.03 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  23.14 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  26.82 
 
 		 342 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.52 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.74 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  22.95 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  21.68 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  22.53 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.99 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.22 
 
 		 329 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  21.72 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  21.72 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.08 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.37 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>