39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3310 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  100 
 
 		 331 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  70.39 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  54.58 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  50.61 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  52.57 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  51.81 
 
 		 331 aa  328  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.18 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  51.06 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.9 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  49.1 
 
 		 332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.34 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  47.29 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.08 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.78 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.73 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  46.13 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  46.13 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  40.68 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.6 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  27.7 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.4 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  25.9 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.61 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.61 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  27.86 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  25.67 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.9 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.5 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.87 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.01 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  23.44 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.67 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  24.63 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.42 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  27.42 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.27 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.84 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.54 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>