42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2543 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  100 
 
 		 328 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  72.56 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.73 
 
 		 328 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.55 
 
 		 328 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  68.81 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  68.81 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.75 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.03 
 
 		 341 aa  269  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.19 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  37.66 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.63 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.23 
 
 		 376 aa  179  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  28.53 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  27.7 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  28.51 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.05 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  26.94 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  26.05 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.09 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  23.21 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.21 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.29 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  23.04 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  25.08 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.47 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.69 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  21.31 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.62 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  25.82 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  25.15 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  25.15 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  24.61 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.14 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.07 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.12 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.72 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.12 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.52 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  25.18 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.71 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.84 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  23.28 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>