40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  100 
 
 
332 aa  682    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  70.39 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  49.54 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  50.33 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  50.3 
 
 
331 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  51.36 
 
 
331 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  51.52 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.89 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.75 
 
 
331 aa  318  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.64 
 
 
331 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.2 
 
 
329 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  47.89 
 
 
332 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.55 
 
 
340 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  48.51 
 
 
335 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  48.51 
 
 
335 aa  308  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.66 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.34 
 
 
331 aa  301  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  39.3 
 
 
342 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.52 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.43 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  26.97 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.24 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  22.65 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  26.78 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.36 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.43 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.43 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.1 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  24.42 
 
 
341 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  23.98 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.36 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.55 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  23.81 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  24 
 
 
352 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  24 
 
 
352 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.49 
 
 
368 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.82 
 
 
357 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  21.14 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.13 
 
 
378 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.86 
 
 
361 aa  42.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.738489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>