31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3553 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 368 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  64.27 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.1 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  42.77 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  41.74 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  42.48 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  40.99 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  42.43 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  42.25 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  42.25 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  28.96 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  25.81 
 
 		 391 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  25.61 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.53 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.92 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  22.71 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  24.23 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  24.72 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.63 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.47 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  23.63 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.05 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  21.01 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.99 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.99 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.4 
 
 		 331 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  22.01 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  22.54 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.84 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.04 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.76 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>