38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3395 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 361 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  75 
 
 		 357 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  66.29 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.79 
 
 		 351 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  60.34 
 
 		 365 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  63.44 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.4 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  61.4 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.25 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.1 
 
 		 368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  30.95 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  25.86 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  22.86 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.09 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.47 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  22.8 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  22.8 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  23.18 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  23.55 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.97 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.61 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.59 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.43 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  23.05 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  20.52 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.19 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.96 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  20.56 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.75 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  20.09 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.17 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  19.94 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.08 
 
 		 329 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.08 
 
 		 329 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  20.28 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  22.07 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.79 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  21.84 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>