42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1379 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 351 aa  726    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  83.59 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  83.59 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  68.22 
 
 		 364 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.79 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  63.16 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  59.65 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  63.03 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.79 
 
 		 367 aa  315  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  42.48 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  34.42 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  28.77 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  22.45 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.35 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  24.09 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  24.74 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  26.25 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  26.25 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  24.22 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.23 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.83 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.83 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.9 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  23.69 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.4 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.33 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.53 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.08 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.08 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  22.64 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  24.05 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  21.38 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.93 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.79 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.01 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.71 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.12 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  24.24 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.48 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  31.58 
 
 		 527 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  21.6 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>