42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3796 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 329 aa  685    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  57.58 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  54.13 
 
 		 327 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  54.38 
 
 		 331 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.76 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.61 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  49.85 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.7 
 
 		 335 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.7 
 
 		 331 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  51.06 
 
 		 332 aa  345  6e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.09 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  48.66 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  48.66 
 
 		 335 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  50.3 
 
 		 340 aa  331  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  47.88 
 
 		 331 aa  328  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  48.18 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  45.45 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  37.62 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.1 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  24.9 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.03 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.03 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.09 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  24.5 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  23.29 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.21 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  26.55 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.55 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.43 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  22.14 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.97 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.08 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  28.11 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.65 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.97 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  19.68 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.86 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  30.56 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.68 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  30.63 
 
 		 368 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.68 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  22.22 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>