31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0542 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 378 aa  781    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.34 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.94 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.63 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  36.63 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  34.22 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  33.33 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  33.63 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  34.1 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.59 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.75 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  29.39 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  22.15 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  23.87 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.38 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  19.68 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  23.37 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  23.55 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  26.03 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.57 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.47 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.37 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.31 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.5 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  19.94 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  20.48 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.97 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  22.97 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  22.4 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  19.89 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.09 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>