41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3308 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  100 
 
 		 331 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  58.43 
 
 		 332 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  54.24 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  54.52 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  54.24 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.88 
 
 		 329 aa  338  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.85 
 
 		 331 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  48.48 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  48.34 
 
 		 332 aa  322  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  46.25 
 
 		 331 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  47.92 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  47.92 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.69 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.92 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.73 
 
 		 335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  48.04 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.37 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  42.96 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  24.54 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.54 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.74 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  23.71 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  25.38 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  25.32 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.08 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.35 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  23.01 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.55 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.62 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  24.48 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.86 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.86 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.06 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.71 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.37 
 
 		 378 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  21.76 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.39 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.09 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.66 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.45 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>