39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2518 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 367 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  64.27 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  46.82 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  44.11 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  47.79 
 
 		 351 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.25 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  43.14 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  46.5 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  46.5 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  45.1 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  32.84 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  27.44 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1195  methane monooxygenase, A subunit, beta chain  24.14 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  30 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.27 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.4 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.4 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.67 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  27.05 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.83 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  28.46 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4861  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.57 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.071764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  25.95 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0542  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.38 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0947319  normal  0.353657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  22.01 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.97 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  22.3 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.89 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2200  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.09 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  21.38 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  21.43 
 
 		 332 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  23.71 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  23.71 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.64 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  22.82 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.32 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.09 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.26 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  21.95 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>