47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0209 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  81.8 
 
 		 516 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 514 aa  1087    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  89.43 
 
 		 519 aa  982    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.59 
 
 		 515 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  84.6 
 
 		 519 aa  945    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  70.5 
 
 		 527 aa  760    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  64.64 
 
 		 537 aa  704    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  66.07 
 
 		 504 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  89.47 
 
 		 528 aa  983    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  90.45 
 
 		 514 aa  993    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  88.48 
 
 		 514 aa  975    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  74.56 
 
 		 517 aa  837    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  68.39 
 
 		 530 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  61.02 
 
 		 511 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  60.08 
 
 		 505 aa  670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  67.58 
 
 		 517 aa  749    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  90.45 
 
 		 514 aa  993    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  59.92 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  26.84 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  28.73 
 
 		 499 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.97 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.02 
 
 		 500 aa  127  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  25.95 
 
 		 501 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.18 
 
 		 497 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.67 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.85 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.85 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.68 
 
 		 501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  27.19 
 
 		 556 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  25.38 
 
 		 555 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  27.29 
 
 		 555 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  26.52 
 
 		 556 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  26.59 
 
 		 555 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  26.59 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  27.88 
 
 		 552 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  29.13 
 
 		 552 aa  97.1  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  25.28 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.51 
 
 		 545 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  29.6 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  32.49 
 
 		 310 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  25.23 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  23.4 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.64 
 
 		 263 aa  72  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.54 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.21 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.4 
 
 		 329 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.4 
 
 		 329 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>