44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1508 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  76.73 
 
 		 552 aa  912    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.36 
 
 		 545 aa  740    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  78.51 
 
 		 552 aa  920    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  82.1 
 
 		 556 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  92.59 
 
 		 555 aa  1088    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  100 
 
 		 555 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  99.64 
 
 		 560 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  80.8 
 
 		 555 aa  972    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  82.46 
 
 		 556 aa  995    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  65.61 
 
 		 549 aa  744    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  38.26 
 
 		 501 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  29.71 
 
 		 527 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  29.07 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  28.12 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.41 
 
 		 501 aa  127  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.47 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.15 
 
 		 501 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.15 
 
 		 501 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  27.94 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.94 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  28.02 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  25.46 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  24.72 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.68 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.55 
 
 		 519 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.2 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  27 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  25.26 
 
 		 511 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.31 
 
 		 497 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.55 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.73 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.73 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  25.68 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.55 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.59 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.01 
 
 		 514 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.01 
 
 		 528 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.66 
 
 		 502 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.47 
 
 		 263 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.3 
 
 		 519 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.21 
 
 		 517 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.65 
 
 		 328 aa  53.5  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.71 
 
 		 328 aa  50.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  27.18 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>