49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.81 
 
 		 514 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.02 
 
 		 514 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.55 
 
 		 519 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  61.32 
 
 		 527 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.85 
 
 		 515 aa  705    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.83 
 
 		 519 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  63.84 
 
 		 537 aa  667    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  83.07 
 
 		 504 aa  911    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.79 
 
 		 528 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  62.1 
 
 		 516 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.86 
 
 		 517 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  60.9 
 
 		 514 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  100 
 
 		 511 aa  1079    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  65.65 
 
 		 530 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  60.08 
 
 		 505 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  59.29 
 
 		 517 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  61.81 
 
 		 514 aa  680    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  60.2 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  27.93 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  27.35 
 
 		 499 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.18 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  27.6 
 
 		 501 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.65 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.71 
 
 		 497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.54 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.08 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.54 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  24.18 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  25.26 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  25.26 
 
 		 555 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  27.88 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  24.15 
 
 		 556 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  27.3 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  25.28 
 
 		 556 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  28.06 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  23.13 
 
 		 555 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  23.14 
 
 		 549 aa  93.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.15 
 
 		 263 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.45 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  23.32 
 
 		 527 aa  80.9  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  22.66 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  27.64 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  28.71 
 
 		 310 aa  66.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0206  copper-transporting P-type ATPase  39.34 
 
 		 821 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  24.47 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 846 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 841 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.01 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  25.69 
 
 		 841 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>