45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4411 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1508  methane monooxygenase  82.46 
 
 		 555 aa  995    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3551  methane/phenol/toluene hydroxylase  63.48 
 
 		 545 aa  729    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1381  methane monooxygenase  82.46 
 
 		 555 aa  988    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0950  propane monoxygenase hydroxylase large subunit  89.71 
 
 		 555 aa  1079    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1651  Methane monooxygenase  79.42 
 
 		 552 aa  939    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.644066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4411  methane monooxygenase  100 
 
 		 556 aa  1170    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3630  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, Alpha chain)  87.05 
 
 		 556 aa  1045    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2792  putative monooxygenase alpha subunit  82.64 
 
 		 560 aa  996    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3397  methane monooxygenase  78.44 
 
 		 552 aa  931    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2520  methane monooxygenase  63.93 
 
 		 549 aa  737    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4807  methane monooxygenase  38.93 
 
 		 501 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1194  methane monooxygenase, A subunit, alpha chain  30.57 
 
 		 527 aa  230  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.549578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1262  Methane monooxygenase  31.64 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  26.88 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.71 
 
 		 500 aa  127  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  25.4 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  27.25 
 
 		 501 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.33 
 
 		 501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.33 
 
 		 501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  24.94 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1328  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.7 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.22 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3113  methane/phenol/toluene hydroxylase  27.21 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2282  phenol hydrolase alpha subunit  26.8 
 
 		 527 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30730  Multi-component phenol hydoxylase, alpha subunit; LapN  26.68 
 
 		 505 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.689171  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3308  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.62 
 
 		 504 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.899627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1702  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2968  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.85 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.11 
 
 		 515 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3552  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.64 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0209  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.52 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4628  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.64 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.329377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3306  phenol hydrolase alpha subunit  24.95 
 
 		 537 aa  104  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.11 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08830  Phenol hydroxylase subunit P3  25.28 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3360  methane/phenol/toluene hydroxylase  26.13 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5683  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.35 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2793  methane/phenol/toluene hydroxylase  25.28 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.368965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3794  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  26.38 
 
 		 517 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00765464  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0548  methane/phenol/toluene hydroxylase  29.61 
 
 		 263 aa  94.4  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.01532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.16 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  27.23 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  25 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  24.34 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.18 
 
 		 328 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>