18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2539 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2539  toluene monooxygenase alpha subunit  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0814  toluene monooxygenase alpha subunit  61.86 
 
 		 499 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1316  methane/phenol/toluene hydroxylase  64.2 
 
 		 500 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.568204  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3820  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  73.33 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.898066  normal  0.0706856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5679  methane/phenol/toluene hydroxylase:YHS  59.78 
 
 		 501 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3556  methane/phenol/toluene hydroxylase  58.7 
 
 		 501 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4632  methane/phenol/toluene hydroxylase  58.7 
 
 		 501 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0855  hypothetical protein  94.44 
 
 		 274 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0756268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1598  toluene-4-monooxygenase system protein A  56.94 
 
 		 494 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0211  methane/phenol/toluene hydroxylase  64.52 
 
 		 531 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.163709 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4857  methane/phenol/toluene hydroxylase  44.44 
 
 		 497 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.082665  normal  0.0406532 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0546  YHS domain-containing protein  37.25 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.783606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1784  methane/phenol/toluene hydroxylase  38.46 
 
 		 515 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2196  YHS domain protein  38.33 
 
 		 310 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0620223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0526  methane/phenol/toluene hydroxylase  31.67 
 
 		 502 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 809 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 755 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 823 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>