More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0986 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0986  resolvase-like protein  100 
 
 
90 aa  185  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  52.94 
 
 
184 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  52.17 
 
 
186 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 
200 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  52.17 
 
 
186 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
186 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  51.76 
 
 
186 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  51.76 
 
 
186 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  51.76 
 
 
185 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  50.59 
 
 
186 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  50.59 
 
 
186 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  50.59 
 
 
186 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  51.14 
 
 
189 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  51.76 
 
 
205 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  50.59 
 
 
186 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  51.19 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  50.59 
 
 
201 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  55.29 
 
 
191 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  50.59 
 
 
186 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  50.59 
 
 
186 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  50.59 
 
 
201 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
192 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  52.94 
 
 
188 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  50 
 
 
183 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  51.76 
 
 
188 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  54.88 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  51.14 
 
 
235 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  46.59 
 
 
188 aa  94.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  48.28 
 
 
188 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  54.65 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  51.16 
 
 
192 aa  90.5  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  46.59 
 
 
183 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.14 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  42.17 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  42.17 
 
 
188 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  53.01 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  53.01 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  47.22 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  45.83 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  42.53 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  42.53 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  42.5 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  40.91 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.91 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  38.2 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  46.59 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  37.08 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  36.67 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.65 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  37.5 
 
 
186 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  39.77 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  41.76 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  40.7 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  39.56 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.29 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  45 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.37 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  40.45 
 
 
186 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  40.66 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  34.15 
 
 
196 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 
185 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  36.78 
 
 
187 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  40.45 
 
 
183 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  39.33 
 
 
193 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  32.95 
 
 
203 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  36.36 
 
 
186 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  42.86 
 
 
217 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  35.23 
 
 
190 aa  60.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  38.82 
 
 
193 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  34.44 
 
 
528 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  38.55 
 
 
196 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  34.44 
 
 
528 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  40.66 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  37.36 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.9 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 
305 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  38.37 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  41.18 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  35.23 
 
 
194 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  32.22 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  41.76 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 
185 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  32.22 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  35.96 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  33.71 
 
 
212 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  37.65 
 
 
290 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  40 
 
 
313 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  37.78 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  37.78 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>