More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1647 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1647  resolvase domain protein  100 
 
 		 120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  55.17 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  50.43 
 
 		 188 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  54.46 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  53.57 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  50.43 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  50 
 
 		 205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  48.7 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  48.7 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  48.7 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  48.28 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  48.28 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  49.14 
 
 		 186 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  49.57 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  49.14 
 
 		 188 aa  110  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  46.55 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  46.55 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  47.41 
 
 		 186 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  47.01 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 185 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  49.14 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  47.32 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 		 192 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  46.55 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  45.45 
 
 		 183 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  43.1 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  49.48 
 
 		 183 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  42.24 
 
 		 187 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  43.1 
 
 		 187 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  43 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.52 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  37.37 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  40.37 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  39.13 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  39.13 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  35.51 
 
 		 188 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  35.51 
 
 		 188 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  38.6 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.34 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  35 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  35 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.86 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.94 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  34.41 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.39 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  36.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.17 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  41.94 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.96 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.17 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  33 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.62 
 
 		 184 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  35.65 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.78 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  34.48 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  34.74 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  34.02 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  34.38 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.42 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  32.46 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  34.41 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  34.69 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0986  resolvase-like protein  45 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  42.17 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.46 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  33.04 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.68 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  33.67 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  32.77 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  32.76 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.26 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  34.07 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  34.41 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  37.63 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  37.63 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  35.77 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  34.41 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  35.77 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  37.36 
 
 		 198 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  35.48 
 
 		 194 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>