More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0265 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0265  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 358 aa  721    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.090274 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  43.22 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  31.7 
 
 		 383 aa  156  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  29.19 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  26.04 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  27.49 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  27.1 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  25.15 
 
 		 464 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  25.44 
 
 		 443 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  27.33 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  26.53 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  27.59 
 
 		 422 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  27.56 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  28.8 
 
 		 424 aa  116  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  23.35 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  24.26 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  26.14 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  22.92 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.65 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  24.77 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  23.96 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  25.29 
 
 		 453 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  26.47 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  26.65 
 
 		 454 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  26.95 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.63 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  25 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  25.96 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  25.15 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  26.95 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  24.44 
 
 		 343 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  25.64 
 
 		 425 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  27.3 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  23.74 
 
 		 423 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  26.55 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  26.04 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  25.32 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  24.62 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  24.92 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  25.56 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  24.4 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  25.77 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  26.62 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  25.63 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  22.81 
 
 		 428 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  24.57 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  25.24 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  25.89 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  25.08 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  24.72 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  25.08 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  25.3 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  26.96 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  25.32 
 
 		 432 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  25.55 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  25.4 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  24.51 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  26.83 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  25.37 
 
 		 420 aa  99.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  23.08 
 
 		 446 aa  99.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 432 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 432 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 434 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  26.01 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 434 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 434 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 434 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  24.16 
 
 		 434 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  24.46 
 
 		 432 aa  99.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  21.08 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  25.57 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  23.99 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  24.63 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  24.14 
 
 		 418 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.12 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  27.06 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  25.88 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  24.48 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  24.92 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  24.69 
 
 		 414 aa  96.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  24.53 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  25.38 
 
 		 438 aa  96.3  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  26.49 
 
 		 416 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  24.51 
 
 		 424 aa  95.9  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  26.56 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  24.78 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  23.51 
 
 		 425 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  26.69 
 
 		 439 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>