279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4571 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4571  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.15 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.01 
 
 		 450 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  32.08 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  27.93 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  29.52 
 
 		 412 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 976 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 844 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 		 441 aa  54.3  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  27.61 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.41 
 
 		 727 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  26.88 
 
 		 262 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 446 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.45 
 
 		 320 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1033 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.33 
 
 		 286 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.43 
 
 		 846 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  26.05 
 
 		 308 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 		 312 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  25.66 
 
 		 213 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  30.87 
 
 		 418 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.42 
 
 		 381 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 862 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  32.95 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.08 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  31.46 
 
 		 825 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  27.5 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  26.79 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3601  pentapeptide repeat protein  35 
 
 		 371 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  29.06 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2505  pentapeptide repeat protein  35 
 
 		 371 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  29.66 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  29.55 
 
 		 870 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  35.23 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  25.83 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 336 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.07 
 
 		 600 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.91 
 
 		 517 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 225 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 336 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 		 261 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 359 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  28.1 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  25.37 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  30.39 
 
 		 234 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  23.5 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  24.39 
 
 		 308 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  30.39 
 
 		 234 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  27.19 
 
 		 291 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 601 aa  48.1  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2247  acetyltransferase  24.39 
 
 		 308 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0012519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2180  acetyltransferase  24.39 
 
 		 308 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000230557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.84 
 
 		 349 aa  48.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 		 343 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 521 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 370 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  30.97 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2411  acetyltransferase  24.39 
 
 		 308 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 		 343 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  22.81 
 
 		 219 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  31.19 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  30 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  36.49 
 
 		 973 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 576 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  31.19 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  19.73 
 
 		 198 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 456 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  25.74 
 
 		 219 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 327 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25.96 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 		 489 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  26.85 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  20.77 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2429  acetyltransferase, gnat family  24.39 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.287092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  28.75 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.61 
 
 		 452 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 442 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>