More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0887 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0887  GMP synthase  100 
 
 
519 aa  1072    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0074  GMP synthase  53.61 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0123  GMP synthase  52.85 
 
 
526 aa  566  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0195  GMP synthase  51.9 
 
 
520 aa  543  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  52.56 
 
 
519 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  51.24 
 
 
523 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  50 
 
 
565 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  49.81 
 
 
535 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  50.38 
 
 
556 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  50.29 
 
 
520 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  50.76 
 
 
518 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  50.29 
 
 
520 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  50.95 
 
 
519 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  51.24 
 
 
526 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  50.76 
 
 
535 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  50.09 
 
 
540 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  50 
 
 
534 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  49.43 
 
 
540 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  50.57 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  49.43 
 
 
521 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  50.19 
 
 
530 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  49.24 
 
 
521 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  50.47 
 
 
513 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  50.28 
 
 
533 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  49.24 
 
 
521 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  49.25 
 
 
541 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  50.38 
 
 
518 aa  485  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  49.71 
 
 
520 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  49.71 
 
 
520 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  49.81 
 
 
511 aa  487  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  49.43 
 
 
518 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  49.91 
 
 
537 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  48.95 
 
 
520 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  50.09 
 
 
520 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  49.53 
 
 
534 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  49.33 
 
 
524 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  49.25 
 
 
512 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  49.44 
 
 
513 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  49.14 
 
 
520 aa  485  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  49.72 
 
 
513 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  49.9 
 
 
528 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  49.9 
 
 
510 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  49.52 
 
 
540 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  48.39 
 
 
509 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  49.63 
 
 
513 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  49.25 
 
 
518 aa  478  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  49.05 
 
 
519 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  48.1 
 
 
508 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  47.33 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  48.08 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  48.69 
 
 
522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  48.77 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  48.32 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  48.95 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  47.43 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  47.14 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  47.8 
 
 
512 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  46.52 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  49.05 
 
 
520 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  48.96 
 
 
525 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  47.73 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  48.3 
 
 
533 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  49.05 
 
 
515 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  46.37 
 
 
515 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  46.92 
 
 
516 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  46.58 
 
 
509 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  46.39 
 
 
509 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  48.39 
 
 
516 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  47.13 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  46.96 
 
 
512 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  46.11 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  49.43 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  48.2 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  48.3 
 
 
518 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  48.39 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  46.72 
 
 
537 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  47.54 
 
 
511 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  47.83 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  47.82 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  46.6 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  46.6 
 
 
518 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  47.53 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  46.9 
 
 
575 aa  455  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  47.45 
 
 
509 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  47.29 
 
 
515 aa  458  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  48.3 
 
 
518 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  46.8 
 
 
575 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  46.03 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  48 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  47.78 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  46.17 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  46.89 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  47.46 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  47.78 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  46.03 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  46.58 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  47.18 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  48.1 
 
 
507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  47.93 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  45.79 
 
 
525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>