152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1483 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  49.77 
 
 
240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  38.71 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  36.61 
 
 
223 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  36.28 
 
 
247 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  39.53 
 
 
234 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 
239 aa  131  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  37.5 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  37.5 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  31.22 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  42.13 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  38.34 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  34.02 
 
 
226 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  38.89 
 
 
233 aa  104  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  34.12 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  39.39 
 
 
229 aa  99  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  33.81 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  33.17 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  34.43 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  33.85 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  36.46 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  33.01 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  31.16 
 
 
233 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  32.37 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  32.52 
 
 
230 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  33.97 
 
 
226 aa  91.3  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  31.5 
 
 
362 aa  89.4  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  34.34 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  42.57 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  31.31 
 
 
231 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  30.81 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  31.28 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  31.55 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  43.56 
 
 
312 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  33.85 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2246  sugar fermentation stimulation protein  38.61 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  31.12 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02851  sugar fermentation stimulation protein A  27.1 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.504492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  29.73 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  30.73 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02841  sugar fermentation stimulation protein A  27.1 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  29.81 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  30.39 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0264  sugar fermentation stimulation protein A  25.68 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  31.79 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  30.43 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  28.38 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  29.17 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02951  sugar fermentation stimulation protein A  27.6 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  27.32 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  27.32 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  25.69 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  27.54 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  27.14 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  34.15 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  27.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  35.14 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  26.67 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  26.67 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  25.23 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  29.56 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  30.93 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  26.51 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  34.78 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  32.58 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  27.96 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  25.71 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  28.64 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  26.96 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  26.96 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  35.9 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  25.71 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  26.67 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  32.52 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  29.8 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  26.24 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  35.4 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  30.65 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  25.34 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  31.71 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  30.88 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  27.56 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  34.71 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  28.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  28.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  28.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  28.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  34.71 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  32.48 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  27.93 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0707  sugar fermentation stimulation protein  29.52 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0456772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  26.92 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  24.09 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>